Озеро Бардзруни расположено в Вайоцдзорской области Армении, на северо-западном склоне горного хребта Айоцдзор, в 3 км к востоку от села Бардзруни, на границе с Нахичеваном, на высоте 2 760 м над уровнем моря. Длина береговой линии составляет  500 м. Рядом с озером расположены села Серс и Мартирос.