Церковь Сурб Гаяне находится в южной части Эчмиадзина, она возведена на месте мученической смерти святой Гаяне и двух ее сподвижниц. По свидетельству Агатангехоса, здесь в 301 г. в результате усилий, приложенных Григорием Просветителем, царская семья в лице Трдата Великого построила часовню. Часовня Сурб Гаяне была обращена в руины персидским царем Шапухом и позднее восстановлена Сааком Партевом.
В 630 г. Eзр I снес часовню и построил на ее месте церковь Сурб Гаяне из тесаного туфа. Церковь представляет собой четырехколонную купольную базилику, под главным алтарем которой находится усыпальница святой.
Позднее церковь святой девы Гаяне была разорена. По свидетельству Аракела Даврижеци, от церкви Сурб Гаяне остались лишь стены и колонны. Католикос Филиппос Ахбакеци положил начало восстановлению церкви.
В 1688 г. Егиазар Айнтапеци построил помещения для монахов, стены, пристроил к церкви трехарочный притвор, построил с южной и северной стороны церкви часовни апостолов Погоса и Петра.
В годы правления католикоса Геворга IV Константинопольского комплекс был отреставрирован.
1910 г. армянская община Нор Нахичевана привезла для могилы святой Гаяне надгробие из черного гранита.
В 1959 г. и 1970-е гг. монастырь подвергался ремонту.
Во дворе монастыря Сурб Гаяне находятся могилы духовных лидеров средневековой Армении, а также исполнительницы армянских духовных песнопений Лусине Закарян.
